Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gbx1P82976 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gbx1P82976 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gbx1P82976 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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