Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gucd1-202ENSMUST00000118936 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm8634-201ENSMUST00000222547 1367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Dclre1c-203ENSMUST00000102988 2469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tfdp1-203ENSMUST00000209396 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 AC140393.1-202ENSMUST00000228347 1818 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irx2P81066 Snx31-201ENSMUST00000013755 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Dtnbos-201ENSMUST00000173847 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irx2P81066 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms