Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Otx1P80205 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Otx1P80205 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Otx1P80205 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms