Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tra2bP62996 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms