Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms