Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms