Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CntfP51642 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CntfP51642 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CntfP51642 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms