Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms