Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtpreP49446 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms