Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprkP35822 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprkP35822 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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