Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Magea8-201ENSMUST00000070141 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm5776-201ENSMUST00000122119 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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