Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RxraP28700 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RxraP28700 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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