Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms