Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms