Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gm3239L7N2D9 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3239L7N2D9 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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