Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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