Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3298E9PW80 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms