Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms