Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms