Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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