Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
OtofQ9ESF1 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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