Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp12Q9D9M2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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