Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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