Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcf1Q9CTH6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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