Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms