Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms