Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rdh13Q8CEE7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms