Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Pramef8Q8CE24 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Pramef8Q8CE24 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms