Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms