Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg1bQ7TSF1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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