Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbtb40Q6PCS8 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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