Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms