Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms