Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb2Q00977 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gjb2Q00977 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms