Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Csf2raQ00941 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csf2raQ00941 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms