Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
H3f3aP84244 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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