Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SftpbP50405 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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