Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tmod1P49813 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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