Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CebpbP28033 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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