Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxd12P23812 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms