Protein–RNA interactions for Protein: P11680

Cfp, Properdin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfpP11680 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CfpP11680 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CfpP11680 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfpP11680 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms