Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms