Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pknox1O70477 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pknox1O70477 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pknox1O70477 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pknox1O70477 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pknox1O70477 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pknox1O70477 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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