Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm2056J3QQ02 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm2056J3QQ02 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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