Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms