Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms