Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm10045-201ENSMUST00000178657 483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm6682-201ENSMUST00000169666 1346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms