Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm6880A3KG45 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm6880A3KG45 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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