Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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