Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms